南昌市体育运动学校对于违纪的学生会进行严肃处理。首先，学校会根据违纪情况进行调查核实，依据校规校纪进行公正处理。处理方式可能包括口头警告、书面通报批评、暂停参加训练或比赛等。对于严重违纪行为，学校可能会进一步处理，如给予记过、开除等处分。总之，学校将依法依规处理学生违纪行为，确保校园秩序和教学质量。同时，学校也会注重与学生沟通，引导他们认识到错误并改正。