南昌市西山职业高级中学的毕业证书与普通高中毕业证书的效力并不完全相同。虽然职业高级中学也提供中等教育，但其教育重点更倾向于职业技能培训，以培养具备一定专业技能的学生为主。而普通高中则更注重基础知识的学习。因此，两者在毕业证书的效力上会有所差异。具体效力还需根据社会需求和用人单位认可程度来判定。