新干中等专业学校的毕业证书与普通高中毕业证书的效力并不完全相同。虽然中专教育也是中等教育的一部分，但中专更侧重于职业技能培训，而普通高中则更注重基础学科教育。因此，中专毕业证书在职业领域可能更有优势，而在学术领域则可能不如普通高中证书受到广泛认可。具体情况还需根据行业标准和具体岗位要求来判断。