赣州现代科技职业学校的毕业证书与普通高中证书效力不同。普通高中毕业证是学生完成高中阶段文化课学习，具备参加高考等升学资格的证明。而该校属职业学校，其毕业证主要证明学生完成相应职业教育课程，在升学途径上，多通过对口单招等方式进入特定院校，就业方向也更侧重专业技能领域，二者在教育体系和发展方向上有明显区别。