武宁中等专业学校的毕业证书与普通高中毕业证书在效力上有所不同。中专毕业证书主要证明学生在特定职业技能领域的学习成果，而普通高中毕业证书则证明学生完成了基础教育的全部课程。因此，在学历认可、升学途径以及就业方面，两者存在一定差异。不过，具体效力还需根据社会需求和用人单位的要求来判断。