吉安市特殊教育学校的毕业证书与普通高中毕业证书的效力并不完全相同。特殊教育学校根据特殊教育需要设置课程，更注重学生的个性化发展和特殊教育能力的提升。因此，虽然特殊教育学校也颁发毕业证书，但它并不等同于普通高中的毕业证书。普通高中的毕业证书更广泛地得到社会认可，通常用于进一步的高等教育或就业。而特殊教育学校的毕业证书更侧重于特殊领域的发展，适用于特定领域的就业机会或进修特殊教育相关专业。