全南县高级职业技术学校的毕业证书与普通高中毕业证书的效力并不完全相同。虽然职业技术学校也提供职业教育，但其教育目标和课程设置与普通高中有所不同。因此，毕业证书的效力取决于具体的情况和所需的要求。在某些情况下，职业技术学校毕业证书可能更适用于职业技能需求，而在其他情况下，普通高中毕业证书可能更有优势。建议根据个人情况和目标职业的需求进行评估。