宁都县科技职业学校的毕业证书与普通高中毕业证书的效力并不完全相同。虽然职业学校教育强调职业技能培养，但其毕业证书通常被视为职业教育阶段的证明，与普通高中毕业证书有所区别。普通高中毕业证书更多地强调学术教育，两者在学历层次和适用范围上存在差异。因此，具体效力还需根据用人单位需求和实际技能要求进行评估。