南昌运输职业技术学校的校园内设有完善的医疗室和心理咨询室。医疗室提供日常的医疗服务，备有常用药品，以便学生在需要时能够及时获得医疗援助。心理咨询室则专注于学生的心理健康，提供专业的心理咨询和心理辅导服务，帮助学生解决学习和生活中遇到的心理问题。这两个设施的存在为在校学生提供了极大的便利。