南昌现代交通学校校园内设有完善的医疗室与心理咨询室。医疗室提供日常医疗服务，配备有专业的医务人员和常用药物，以便及时应对学生突发状况。同时，心理咨询室也具备专业心理咨询师，针对学生在学业、生活或职业规划上的心理问题，提供专业的心理疏导与帮助。两室的设立极大程度地保障了学生的身心健康。